การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดในความปลอดภัยของอาหาร: สภาวะของการเล่น

EFSA ได้ตีพิมพ์รายงานสองฉบับซึ่งให้ภาพว่าการจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (WGS) สามารถนำมาใช้ในความปลอดภัยของอาหารได้อย่างไร และมีการใช้เทคนิคดังกล่าวในยุโรปมากเพียงใด WGS มีการใช้งานมากขึ้นในห้องปฏิบัติการด้านสาธารณสุขและความปลอดภัยของอาหาร แต่มีการใช้ในรูปแบบต่างๆ ในประเทศต่างๆ และเพื่อวัตถุประสงค์ที่แตกต่างกัน แบบสำรวจการใช้ WGS

ผลการสำรวจที่ดำเนินการโดย EFSA 

และคณะกรรมาธิการยุโรปในปี 2559 เกี่ยวกับการใช้ WGS สำหรับเชื้อโรคในอาหารและน้ำที่แยกได้จากสัตว์ อาหาร อาหารสัตว์ และสิ่งแวดล้อมในกลุ่มประเทศ EU/EFTAได้แก่: ภายในสิ้นปี 2559 WGS ถูกใช้ในห้องปฏิบัติการแล้วใน 17 จาก 30 ประเทศ สาเหตุหลักที่ไม่ใช้ WGS คือการขาดความเชี่ยวชาญและทรัพยากรทางการเงิน WGS ส่วนใหญ่ใช้เพื่อสนับสนุนการสอบสวนการระบาด ENGAGE โครงการ

รายงานสุดท้ายของโครงการ “ การสร้างความสามารถในการจัดลำดับรุ่นต่อไปสำหรับการวิเคราะห์จีโนมในยุโรป” (ENGAGE)รวมถึงคำอธิบายของเหตุการณ์สำคัญทั้งหมดที่ทำได้ – ซึ่งรวมถึงการเผยแพร่ลำดับแบคทีเรียต่อสาธารณะ สิ่งพิมพ์ทางวิทยาศาสตร์ แบบฝึกหัดการเปรียบเทียบ เวิร์กช็อป การฝึกอบรม และ e- สื่อการเรียนรู้

เป้าหมายของโครงการซึ่งได้รับทุนสนับสนุนจาก EFSA คือการส่งเสริมความร่วมมือทางวิทยาศาสตร์ระหว่างห้องปฏิบัติการในยุโรปเพื่อใช้ WGS ในด้านความปลอดภัยของอาหารและการคุ้มครองด้านสาธารณสุข

เมื่อเมล็ดพืชงอก รากของมันจะต้องกำหนดทิศทางของแรงโน้มถ่วงอย่างรวดเร็วและโค้งงอเพื่อให้เติบโตลึกลงไปในดิน ที่ซึ่งมันสามารถยึดตัวเองได้ และพบน้ำและสารอาหาร เพื่อที่จะโค้งงอ การเจริญเติบโตของเซลล์จะได้รับอนุญาตให้ดำเนินต่อไปที่ด้านหนึ่งของรากในขณะที่ถูกยับยั้งอีกด้านหนึ่ง เป็นที่ทราบกันว่าการยับยั้งนี้ถูกกระตุ้นโดยฮอร์โมนออกซินและเกิดขึ้นเร็วมาก แต่เวลาตอบสนองที่แน่นอนนั้นยากต่อการวัด นักวิจัยสามารถวัดเวลาที่รากต้องตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงความเข้มข้นของออกซินได้อย่างแม่นยำโดยใช้การตั้งค่าที่เป็นนวัตกรรม พวกเขาสรุปว่าการปรับตัวอย่างรวดเร็วของอัตราการเติบโตนั้นเร็วเกินไปที่จะอธิบายโดยกลไกการถอดรหัสยีน ดังนั้นจึงต้องเกี่ยวข้องกับกลไกการรับรู้อย่างรวดเร็วที่สอดคล้องกัน

สาขาใหม่ในทางเดินเก่า

แต่กลไกใหม่ยังไม่ทราบแน่ชัด ส่วนประกอบของเส้นทางที่ได้รับการศึกษาอย่างดีคือตัวรับ TIR1 จำเป็นสำหรับกลไกที่ค้นพบใหม่ “ด้วยการตั้งค่าการทดลองของเรา เราได้พิสูจน์แล้วว่าการส่งสัญญาณไม่ใช่การถอดเสียง แต่เราได้เห็นแล้วว่าจำเป็นต้องมีองค์ประกอบของเส้นทางการถอดความดั้งเดิม” Jiří Friml ศาสตราจารย์ที่ IST Austria และหัวหน้ากลุ่มวิจัยอธิบาย “นี่หมายความว่าเราไม่ได้มองหาเส้นทางใหม่ทั้งหมด แต่เป็นสาขาใหม่ของทางเดินตามรูปแบบบัญญัติ” เขากล่าวเสริม

ด้วยกล้องจุลทรรศน์แบบพลิกกลับและไมโครแชนเนลที่เติมของเหลว

ด้วยกล้องจุลทรรศน์ที่พลิกด้านข้างซึ่งเป็นวิธีการที่พัฒนาขึ้นก่อนหน้านี้โดยกลุ่มวิจัยเดียวกันและนำไปสู่การผลิตวิดีโอที่น่าทึ่งของรากที่กำลังเติบโตซึ่งได้รับรางวัลเมื่อปีที่แล้ว “ การแข่งขัน Nikon Small World in Motion” — ทีมงานสามารถสังเกตการเติบโตของรากในแนวธรรมชาติ แต่การวัดเวลาปฏิกิริยาจำเป็นต้องมีการพัฒนาเทคนิคเพิ่มเติม: พวกเขาจำเป็นต้องสามารถเปลี่ยนสารละลายที่รากเติบโตได้อย่างรวดเร็ว

“โดยปกติ ผู้คนจะใช้ออกซินแล้วต่อตัวอย่างกับกล้องจุลทรรศน์ แต่ด้วยวิธีนี้ พวกเขาจะสูญเสียวินาทีอันมีค่าหรือแม้แต่นาที—และสองสามนาทีแรกเหล่านั้นก็เป็นสิ่งที่จำเป็นสำหรับการศึกษานี้อย่างแน่นอน” Matyáš อธิบาย Fendrych ผู้เขียนชั้นนำของการศึกษานี้ อดีต postdoc ในกลุ่มของ Jiří Friml และปัจจุบันเป็นผู้ช่วยศาสตราจารย์ที่ Charles University ในกรุงปราก วิธีแก้ปัญหาที่ทีมพบคือปล่อยให้รากงอกในช่องจุลภาคที่เต็มไปด้วยของเหลวที่ต้องการ “สิ่งนี้ทำให้เราเปลี่ยนความเข้มข้นของออกซินและวัดปฏิกิริยาของรากได้ทันที” เขากล่าวเสริม

Credit : portlandbuddhisthub.org jeffandsabrinawilliams.com cjsproperties.net nwawriters.org vawa4all.org liquidbubbleduplication.com northbysouththeatrela.org llanarthstud.com sanderscountyarts.org cincymotorsports.org